1
7
2
0. Galilee, M.; Britan-Rosich, E.; Griner, S. L.; Uysal, S.;
Newman, J.; Dolezal, O.; Mulder, R.; Ryan, J. H.; Savage, G.
P.; Francis, C. L.; Deadman, J. J. PLoS One 2012, 7, e40147.
ACCEPTED MANUSCRIPT
Baumgartel, V.; Lamb, D. C.; Kossiakoff, A. A.; Kotler, M.;
Stroud, R. M.; Marx, A.; Alian, A. Structure (Oxford, U. K.) 2016,
44. Wielens, J.; Headey Stephen, J.; Rhodes David, I.; Mulder Roger,
J.; Dolezal, O.; Deadman John, J.; Newman, J.; Chalmers David,
K.; Parker Michael, W.; Peat Thomas, S.; Scanlon Martin, J. J.
Biomol. Screen. 2013, 18, 147-59.
2
4, 1936-1946.
1. Wang, J.-Y.; Ling, H.; Yang, W.; Craigie, R. EMBO J. 2001, 20,
333-7343.
2
2
2
2
2
7
2. Chen, I. J.; Neamati, N.; MacKerell, A. D., Jr. Curr. Drug Targets
Infect. Disord. 2002, 2, 217-234.
3. Bujacz, G.; Alexandratos, J.; Zhou-Liu, Q.; Clement-Mella, C.;
Wlodawer, A. FEBS Lett. 1996, 398, 175-178.
4. Dyda, F.; Hickman, A. B.; Jenkins, T. M.; Engelman, A.; Craigie,
R.; Davies, D. R. Science (Washington, D. C.) 1994, 266, 1981-6.
5. Chen, J. C. H.; Krucinski, J.; Miercke, L. J. W.; Finer-Moore, J.
S.; Tang, A. H.; Leavitt, A. D.; Stroud, R. M. Proc. Natl. Acad.
Sci. U. S. A. 2000, 97, 8233-8238.
6. Wielens, J.; Headey, S. J.; Jeevarajah, D.; Rhodes, D. I.;
Deadman, J.; Chalmers, D. K.; Scanlon, M. J.; Parker, M. W.
FEBS Lett. 2010, 584, 1455-1462.
45. Northfield, S. E.; Wielens, J.; Headey Stephen, J.; Mulcair, M.;
Scanlon Martin, J.; Parker Michael, W.; Thompson, P. E.;
Chalmers David, K.
http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=3WNF
2013, to be published.
46. Northfield, S. E.; Wielens, J.; Headey Stephen, J.; Mulcair, M.;
Scanlon Martin, J.; Parker Michael, W.; Thompson, P. E.;
Chalmers David, K.
http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=4y1c
2015, to be published.
47. Northfield, S. E.; Wielens, J.; Headey Stephen, J.; Mulcair, M.;
Scanlon Martin, J.; Parker Michael, W.; Thompson, P. E.;
Chalmers David, K.
http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=4y1d
2015, to be published.
48. Northfield, S. E.; Wielens, J.; Headey, S., J.; Mulcair, M.; Scanlon
Martin, J.; Parker Michael, W.; Thompson, P. E.; Chalmers David,
K.
2
2
2
7. Maignan, S.; Guilloteau, J.-P.; Zhou-Liu, Q.; Clement-Mella, C.;
Mikol, V. J. Mol. Biol. 1998, 282, 359-368.
8. Le Rouzic, E.; Bonnard, D.; Chasset, S.; Bruneau, J.-M.;
Chevreuil, F.; Le Strat, F.; Nguyen, J.; Beauvoir, R.; Amadori, C.;
Brias, J.; Vomscheid, S.; Eiler, S.; Levy, N.; Delelis, O.; Deprez,
E.; Saib, A.; Zamborlini, A.; Emiliani, S.; Ruff, M.; Ledoussal, B.;
Moreau, F.; Benarous, R. Retrovirology 2013, 10, 144/1-144/21,
http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=3WNE
2013, to be published.
2
1 pp.
2
3
3
3
9. Goldgur, Y.; Dyda, F.; Hickman, A. B.; Jenkins, T. M.; Craigie,
49. Northfield, S. E.; Wielens, J.; Headey Stephen, J.; Mulcair, M.;
Scanlon Martin, J.; Parker Michael, W.; Thompson, P. E.;
Chalmers David, K.
http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=3wng
2013, to be published.
50. Northfield, S. E.; Wielens, J.; Headey Stephen, J.; Mulcair, M.;
Scanlon Martin, J.; Parker Michael, W.; Thompson, P. E.;
Chalmers David, K.
R.; Davies, D. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998, 95, 9150-
9
154.
0. Goldgur, Y.; Craigie, R.; Cohen, G. H.; Fujiwara, T.; Yoshinaga,
T.; Fujishita, T.; Sugimoto, H.; Endo, T.; Murai, H.; Davies, D. R.
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999, 96, 13040-13043.
1. Molteni, V.; Greenwald, J.; Rhodes, D.; Hwang, Y.; Kwiatkowski,
W.; Bushman, F. D.; Siegel, J. S.; Choe, S. Acta Crystallogr.,
Sect. D Biol. Crystallogr. 2001, D57, 536-544.
2. Kessl, J. J.; Jena, N.; Koh, Y.; Taskent-Sezgin, H.; Slaughter, A.;
Feng, L.; de Silva, S.; Wu, L.; Le Grice, S. F. J.; Engelman, A.;
Fuchs, J. R.; Kvaratskhelia, M. J. Biol. Chem. 2012, 287, 16801-
http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=3wnh
2013, to be published.
51. Zhao, X. Z.; Smith, S. J.; Maskell, D. P.; Métifiot, M.; Pye, V. E.;
Fesen, K.; Marchand, C.; Pommier, Y.; Cherepanov, P.; Hughes,
S. H.; Burke, T. R. J. Med. Chem. 2017, 60, 7315-7332.
52. Ribeiro, A. J. M.; Ramos, M. J.; Fernandes, P. A. J. Am. Chem.
Soc. 2012, 134, 13436-13447.
53. Bhatt, H.; Patel, P.; Pannecouque, C. Chem. Biol. Drug Des. 2014,
83, 154-166.
54. Gupta, P.; Garg, P.; Roy, N. Chem. Biol. Drug Des. 2012, 79, 835-
849.
55. Reddy, K. K.; Singh, S. K.; Tripathi, S. K.; Selvaraj, C. SAR
QSAR Environ. Res. 2013, 24, 581-595.
56. de Carvalho, L. L.; Maltarollo, V. G.; Ferreira de Lima, E.;
Weber, K. C.; Honorio, K. M.; da Silva, A. B. F. PLoS One 2014,
9, e81301/1-e81301/9, 9 pp.
57. Perryman, A. L.; Forli, S.; Morris, G. M.; Burt, C.; Cheng, Y.-H.;
Palmer, M. J.; Whitby, K.; McCammon, J. A.; Phillips, C.; Olson,
A. J. J. Mol. Biol. 2010, 397, 600-615.
58. Gu, W.-g.; Ip, D. T.-M.; Liu, S.-j.; Chan, J. H.; Wang, Y.; Zhang,
X.; Zheng, Y.-t.; Wan, D. C.-C. Chem.-Biol. Interact. 2014, 213,
21-27.
1
6811.
3
3
3
3
3. Tsiang, M.; Jones, G. S.; Niedziela-Majka, A.; Kan, E.; Lansdon,
E. B.; Huang, W.; Hung, M.; Samuel, D.; Novikov, N.; Xu, Y.;
Mitchell, M.; Guo, H.; Babaoglu, K.; Liu, X.; Geleziunas, R.;
Sakowicz, R. J. Biol. Chem. 2012, 287, 21189-21203.
4. Feng, L.; Sharma, A.; Slaughter, A.; Jena, N.; Koh, Y.; Shkriabai,
N.; Larue, R. C.; Patel, P. A.; Mitsuya, H.; Kessl, J. J.; Engelman,
A.; Fuchs, J. R.; Kvaratskhelia, M. J. Biol. Chem. 2013, 288,
1
5813-15820.
5. Jurado, K. A.; Wang, H.; Slaughter, A.; Feng, L.; Kessl, J. J.; Koh,
Y.; Wang, W.; Ballandras-Colas, A.; Patel, P. A.; Fuchs, J. R.;
Kvaratskhelia, M.; Engelman, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
2
013, 110, 8690-8695, S8690/1-S8690/7.
6. Sharma, A.; Slaughter, A.; Feng, L.; Kessl Jacques, J.;
Kvaratskhelia, M.; Jena, N.; Fuchs James, R.; Fadel Hind, J.;
Poeschla, E.; Malani, N.; Male, F.; Bushman Frederic, D.; Wu, L.
PLoS Pathog. 2014, 10, e1004171.
7. Peat, T. S.; Dolezal, O.; Newman, J.; Mobley, D.; Deadman, J. J.
J. Comput.-Aided Mol. Des. 2014, 28, 347-362.
8. Slaughter, A.; Jurado, K. A.; Deng, N.; Feng, L.; Kessl, J. J.;
Shkriabai, N.; Larue, R. C.; Fadel, H. J.; Patel, P. A.; Jena, N.;
Fuchs, J. R.; Poeschla, E.; Levy, R. M.; Engelman, A.;
Kvaratskhelia, M. Retrovirology 2014, 11, 100/1-100/28, 28 pp.
9. Gupta, K.; Turkki, V.; Sherrill-Mix, S.; Hwang, Y.; Eilers, G.;
Taylor, L.; McDanal, C.; Wang, P.; Temelkoff, D.; Nolte, R. T.;
Velthuisen, E.; Jeffrey, J.; Van Duyne, G. D.; Bushman, F. D.
PLoS Biol. 2016, 14, e1002584/1-e1002584/24.
0. Rhodes, D. I.; Peat, T. S.; Vandegraaff, N.; Jeevarajah, D.; Le, G.;
Jones, E. D.; Smith, J. A.; Coates, J. A. V.; Winfield, L. J.;
Thienthong, N.; Newman, J.; Lucent, D.; Ryan, J. H.; Savage, G.
P.; Francis, C. L.; Deadman, J. J. Antiviral Chem. Chemother.
3
3
59. Reddy, K. K.; Singh, P.; Singh, S. K. Mol. Biosyst. 2014, 10, 526-
536.
60. Serrao, E.; Xu, Z.-L.; Debnath, B.; Christ, F.; Debyser, Z.; Long,
Y.-Q.; Neamati, N. Bioorg. Med. Chem. 2013, 21, 5963-5972.
61. Serrao, E.; Debnath, B.; Otake, H.; Kuang, Y.; Christ, F.; Debyser,
Z.; Neamati, N. J. Med. Chem. 2013, 56, 2311-2322.
62. De Luca, L.; Morreale, F.; Chimirri, A. J. Chem. Inf. Model. 2012,
52, 3245-3254.
63. Dayam, R.; Neamati, N. Bioorg. Med. Chem. 2004, 12, 6371-
6381.
64. Anderson, A. C. Chem. Biol. 2003, 10, 787-797.
65. Bergner, A.; Gunther, J.; Hendlich, M.; Klebe, G.; Verdonk, M.
Biopolymers 2002, 61, 99-110.
3
4
2
011, 21, 155-168.
66. Sotriffer, C. A.; Ni, H.; McCammon, J. A. J. Med. Chem. 2000,
43, 4109-4117.
67. Liao, C.; Nicklaus, M. C. ChemMedChem 2010, 5, 1053-1066.
68. Morris, G. M.; Goodsell, D. S.; Halliday, R. S.; Huey, R.; Hart,
W. E.; Belew, R. K.; Olson, A. J. J. Comput. Chem. 1998, 19,
1639-1662.
69. Gupta, K.; Brady, T.; Dyer Benjamin, M.; Malani, N.; Hwang, Y.;
Male, F.; Nolte Robert, T.; Wang, L.; Velthuisen, E.; Jeffrey, J.;
Van Duyne Gregory, D.; Bushman Frederic, D. J. Biol. Chem.
4
4
4
1. Wielens, J.; Headey, S. J.; Deadman, J. J.; Rhodes, D. I.; Le, G.
T.; Parker, M. W.; Chalmers, D. K.; Scanlon, M. J.
ChemMedChem 2011, 6, 258-61.
2. Rhodes, D. I.; Peat, T. S.; Vandegraaff, N.; Jeevarajah, D.;
Newman, J.; Martyn, J.; Coates, J. A. V.; Ede, N. J.; Rea, P.;
Deadman, J. J. ChemBioChem 2011, 12, 2311-2315.
3. Peat, T. S.; Rhodes, D. I.; Vandegraaff, N.; Le, G.; Smith, J. A.;
Clark, L. J.; Jones, E. D.; Coates, J. A. V.; Thienthong, N.;
2
014, 289, 20477-88.