Journal of the American Chemical Society
Article
(6) Solomon, S.; Sanders, R. W.; Garcia, R. R.; Keys, J. G. Nature
1993, 363, 245−248.
(39) Covarrubias, A. S.; Bergfors, T.; Jones, T. A.; Hogbom, M. J.
̈
Biol. Chem. 2006, 281, 4993−4999.
(40) De Simone, G.; Supuran, C. T. J. Inorg. Biochem. 2012, 111,
117−129.
(7) Bruhl, C.; Lelieveld, J.; Crutzen, P. J.; Tost, H. Atmos. Chem. Phys.
̈
2012, 12, 1239−1253.
(41) Minakuchi, T.; Nishimori, I.; Vullo, D.; Scozzafava, A.; Supuran,
C. T. J. Med. Chem. 2009, 52, 2226−2232.
(8) Aydin, M.; Williams, M. B.; Tatum, C.; Saltzman, E. S. Atmos.
Chem. Phys. 2008, 8, 7533−7542.
(42) Smith, K. S.; Ferry, J. G. J. Bacteriol. 1999, 181, 6247−6253.
(9) Watts, S. F. Atmos. Environ. 2000, 34, 761−779.
(10) Kesselmeier, J.; Teusch, N.; Kuhn, U. J. Geophys. Res.: Atmos.
1999, 104, 11577−11584.
̌ ́ ̌ ̌ ́ ̌
(43) Petrek, M.; Otyepka, M.; Banas, P.; Kosinova, P.; Koca, J.;
Damborsky, J. BMC Bioinf. 2006, 7, 316.
́
(44) Kato, H.; Saito, M.; Nagahata, Y.; Katayama, Y. Microbiology
2008, 154, 249−255.
(11) Saito, M.; Honna, T.; Kanagawa, T.; Katayama, Y. Microbes
Environ. 2002, 17, 32−38.
(45) Smith, K. S.; Jakubzick, C.; Whittam, T. S.; Ferry, J. G. Proc.
Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 15184−15189.
(46) Li, X. S.; Sato, T.; Ooiwa, Y.; Kusumi, A.; Gu, J.-D.; Katayama,
Y. Microb. Ecol. 2010, 60, 96−104.
(12) Chengelis, C. P.; Neal, R. A. Biochem. Biophys. Res. Commun.
1979, 90, 993−999.
(13) Miller, A. G.; Espie, G. S.; Canvin, D. T. Plant Physiol. 1989, 90,
1221−1231.
(47) Ueno, Y.; Johnson, M. S.; Danielache, S. O.; Eskebjerg, C.;
Pandey, A.; Yoshida, N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 14784−
14789.
(48) Chae, Y. M.; Tabatabai, M. A. Anal. Lett. 1983, 16, 1197−1206.
(49) Wilhelm, E.; Battino, R.; Wilcock, R. J. Chem. Rev. 1977, 77,
219−262.
(50) De Bruyn, W. J.; Swartz, E.; Hu, J. H.; Shorter, J. A.; Davidovits,
P.; Worsnop, D. R.; Zahniser, M. S.; Kolb, C. E. J. Geophys. Res.: Atmos.
1995, 100, 7245−7251.
(51) Dean, J. A. Electrolytes, Electromotive Force, and Chemical
Equilibrium: Lange’s Handbook of Chemistry, 15th ed.; McGraw-Hill:
New York, 1999; pp 8.1−8.169.
(52) Khalifah, R. G. J. Biol. Chem. 1971, 246, 2561−2573.
(53) Staudinger, J.; Roberts, P. V. Chemosphere 2001, 44, 561−576.
(54) Otwinowski, Z.; Minor, W. Methods Enzymol. 1997, 276, 307−
326.
(55) Vagin, A.; Teplyakov, A. J. Appl. Crystallogr. 1997, 30, 1022−
1025.
(14) Kesselmeier, J.; Merk, L. Biogeochemistry 1993, 23, 47−59.
(15) Protoschill-Krebs, G.; Wilhelm, C.; Kesselmeier, J. Bot. Acta
1995, 108, 445−448.
(16) Protoschill-Krebs, G.; Wilhelm, C.; Kesselmeier, J. Atmos.
Environ. 1996, 30, 3151−3156.
(17) Haritos, V. S.; Dojchinov, G. Comp. Biochem. Physiol., Part C:
Toxicol. Pharmacol. 2005, 140, 139−147.
(18) Supuran, C. T. Nat. Rev. Drug Discovery 2008, 7, 168−181.
(19) Alterio, V.; Di Fiore, A.; D’Ambrosio, K.; Supuran, C. T.; De
Simone, G. Chem. Rev. 2012, 112, 4421−4468.
(20) Seefeldt, L. C.; Rasche, M. E.; Ensign, S. A. Biochemistry 1995,
34, 5382−5389.
(21) Ensign, S. A. Biochemistry 1995, 34, 5372−5381.
(22) Lorimer, G. H.; Pierce, J. J. Biol. Chem. 1989, 264, 2764−2772.
(23) Smeulders, M. J.; Barends, T. R. M.; Pol, A.; Scherer, A.;
Zandvoort, M. H.; Udvarhelyi, A.; Khadem, A. F.; Menzel, A.;
Hermans, J.; Shoeman, R. L.; Wessels, H. J. C. T.; van den Heuvel, L.
P.; Russ, L.; Schlichting, I.; Jetten, M. S. M.; Op den Camp, H. J. M.
Nature 2011, 478, 412−416.
(56) Murshudov, G. N.; Vagin, A. A.; Dodson, E. J. Acta Crystallogr.,
Sect. D: Biol. Crystallogr. 1997, 53, 240−255.
(24) Huber, H.; Stetter, K. O. Genus II. Acidianus Segerer, Neuner,
Kristjansson and Stetter 1986, 561VP. In Bergey’s Manual of Systematic
Bacteriology, 2nd ed.; Garrity, G. M., Boone, D. R., Castenholz, R. W.,
Eds.; Springer: New York, 2001; Vol.1, pp 202−204.
(25) Kelly, D. P.; Wood, A. P.; Stackebrandt, E. Genus II. Thiobacillus
Beijerinck 1904b, 597AL. In Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology,
2nd ed.; Garrity, G. M., Brenner, D. J., Krieg, N. R., Staley, J. T., Eds.;
Springer: New York, 2005; Vol. 2, Part C, pp 764−769.
(26) Katayama, Y.; Narahara, Y.; Inoue, Y.; Amano, F.; Kanagawa, T.;
Kuraishi, H. J. Biol. Chem. 1992, 267, 9170−9175.
(27) Fahey, J. W.; Zalcmann, A. T.; Talalay, P. Phytochemistry 2001,
56, 5−51.
(57) Emsley, P.; Cowtan, K. Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.
2004, 60, 2126−2132.
(58) Sheldrick, G. M. Acta Crystallogr., Sect. A: Found. Crystallogr.
2008, 64, 112−122.
(59) Brunger, A. T. Nature 1992, 355, 472−475.
̈
(60) Tamura, K.; Peterson, D.; Peterson, N.; Stecher, G.; Nei, M.;
Kumar, S. Mol. Biol. Evol. 2011, 28, 2731−2739.
(28) Valdes
34, 9−23.
́
, M. G.; Díaz-García, M. E. Crit. Rev. Anal. Chem. 2004,
(29) Katayama, Y.; Hashimoto, K.; Nakayama, H.; Mino, H.; Nojiri,
M.; Ono, T.; Nyunoya, H.; Yohda, M.; Takio, K.; Odaka, M. J. Am.
Chem. Soc. 2006, 128, 728−729.
(30) Katayama, Y.; Matsushita, Y.; Kaneko, M.; Kondo, M.; Mizuno,
T.; Nyunoya, H. J. Bacteriol. 1998, 180, 2583−2589.
(31) Arakawa, T.; Kawano, Y.; Kataoka, S.; Katayama, Y.; Kamiya, N.;
Yohda, M.; Odaka, M. J. Mol. Biol. 2007, 366, 1497−1509.
(32) Kim, S.-J.; Katayama, Y. Water Res. 2000, 34, 2887−2894.
(33) Smith, K. S.; Ferry, J. G. FEMS Microbiol. Rev. 2000, 24, 335−
366.
(34) Rowlett, R. S. Biochim. Biophys. Acta, Proteins Proteomics 2010,
1804, 362−373.
(35) Kimber, M. S.; Pai, E. F. EMBO J. 2000, 19, 1407−1418.
(36) Holm, L.; Kaariainen, S.; Rosenstrom, P.; Schenkel, A.
̈
̈
̈
̈
Bioinformatics 2008, 24, 2780−2781.
(37) Covarrubias, A. S.; Larsson, A. M.; Hogbom, M.; Lindberg, J.;
̈
Bergfors, T.; Bjorkelid, C.; Mowbray, S. L.; Unge, T.; Jones, T. A. J.
̈
Biol. Chem. 2005, 280, 18782−18789.
(38) Strop, P.; Smith, K. S.; Iverson, T. M.; Ferry, J. G.; Rees, D. C. J.
Biol. Chem. 2001, 276, 10299−10305.
3825
dx.doi.org/10.1021/ja307735e | J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 3818−3825