Chemistry - A European Journal
10.1002/chem.202101171
FULL PAPER
[
[
1] D. P. Bartel, Cell 2018, 173, 20-51.
2] H. Guo, N. T. Ingolia, J. S. Weissman and D. P. Bartel, Nature
[18] a) X. Lu and K. Zhang, Nano research 2018, 11, 5519-5534; b)
W. Pils and R. Micura, Nucleic Acids Research 2000, 28, 1859-
1863.
[19] a) U. Pradere, A. Brunschweiger, L. F. Gebert, M. Lucic, M.
Roos and J. Hall, Angew Chem Int Ed Engl 2013, 52, 12028-12032;
Angew. Chem. 2013,125, 12250 –12254; b) D. Hei, International
Patent 1996; c) S. T. Isaacs, C.-K. J. Shen, J. E. Hearst and H.
Rapoport, Biochemistry 1977, 16, 1058-1064.
[20] a) A. M. MacMillan and G. L. Verdine, The Journal of Organic
Chemistry 1990, 55, 5931-5933; b) C. R. Allerson, S. L. Chen and G.
L. Verdine, Journal of the American Chemical Society 1997, 119,
7423-7433; c) L. Büttner, J. Seikowski, K. Wawrzyniak, A. Ochmann
and C. Höbartner, Bioorganic & Medicinal Chemistry 2013, 21, 6171-
6180.
2
[
010, 466, 835-840.
3] a) R. S. Pillai, S. N. Bhattacharyya, C. G. Artus, T. Zoller, N.
Cougot, E. Basyuk, E. Bertrand and W. Filipowicz, Science 2005,
09, 1573-1576; b) G. Mathonnet, M. R. Fabian, Y. V. Svitkin, A.
3
Parsyan, L. Huck, T. Murata, S. Biffo, W. C. Merrick, E.
Darzynkiewicz, R. S. Pillai, W. Filipowicz, T. F. Duchaine and N.
Sonenberg, Science 2007, 317, 1764-1767; c) M. Kiriakidou, G. S.
Tan, S. Lamprinaki, M. De Planell-Saguer, P. T. Nelson and Z.
Mourelatos, Cell 2007, 129, 1141-1151.
[
4] a) C. Shin, J. W. Nam, K. K. Farh, H. R. Chiang, A. Shkumatava
and D. P. Bartel, Mol Cell 2010, 38, 789-802; b) H. C. Martin, S.
Wani, A. L. Steptoe, K. Krishnan, K. Nones, E. Nourbakhsh, A.
Vlassov, S. M. Grimmond and N. Cloonan, Genome Biology 2014,
[21] K. Shah, H. Wu and T. M. Rana, Bioconjugate Chemistry 1994,
5, 508-512.
1
5, R51.
[
5] a) M. C. Vella, E.-Y. Choi, S.-Y. Lin, K. Reinert and F. J. Slack,
[22] O. Domingo, I. Hellmuth, A. Jaschke, C. Kreutz and M. Helm,
Nucleic Acids Res 2015, 43, 5275-5283.
[23] a) A. R. Cervi, A. Guy, G. A. Leonard, R. Téoule and W. N.
Hunter, Nucleic acids research 1993, 21, 5623-5629; b) J. A.
Grasby, M. Singh, J. Karn and M. J. Gait, Nucleosides and
Nucleotides 1995, 14, 1129-1132.
Genes & Development 2004, 18, 132-137; b) S. W. Chi, G. J.
Hannon and R. B. Darnell, Nat Struct Mol Biol 2012, 19, 321-327.
[
Biology 2006, 13, 849; b) J. Brennecke, A. Stark, R. B. Russell and
S. M. Cohen, PLOS Biology 2005, 3, e85; c) G. B. Loeb, A. A. Khan,
D. Canner, J. B. Hiatt, J. Shendure, R. B. Darnell, C. S. Leslie and A.
Y. Rudensky, Mol Cell 2012, 48, 760-770.
6] a) D. Didiano and O. Hobert, Nature Structural &Amp; Molecular
[24] J. Brzezinska, Z. Gdaniec, L. Popenda and W. T. Markiewicz,
Biochim Biophys Acta 2014, 1840, 1163-1170.
[
7] a) J. R. Lytle, T. A. Yario and J. A. Steitz, Proc Natl Acad Sci U S
A 2007, 104, 9667-9672; b) A. Brummer and J. Hausser, Bioessays
014, 36, 617-626; c) Y. Tay, J. Zhang, A. M. Thomson, B. Lim and
I. Rigoutsos, Nature 2008, 455, 1124-1128.
8] a) L. Poliseno, L. Salmena, J. Zhang, B. Carver, W. J. Haveman
[25] M. Menzi, U. Pradere, Y. Wang, M. Fischer, F. Baumann, M.
Bigatti and J. Hall, Chembiochem 2016, 17, 2012-2017.
[26] J. A. Zagalak, M. Menzi, F. Schmich, H. Jahns, A. M. Dogar, F.
Wullschleger, H. Towbin and J. Hall, RNA 2015, 21, 2132-2142.
[27] S. Griffiths-Jones, R. J. Grocock, S. van Dongen, A. Bateman
and A. J. Enright, Nucleic Acids Research 2006, 34, D140-D144.
2
[
and P. P. Pandolfi, Nature 2010, 465, 1033; b) M. Cesana, D.
Cacchiarelli, I. Legnini, T. Santini, O. Sthandier, M. Chinappi, A.
Tramontano and I. Bozzoni, Cell 2011, 147, 358-369; c) J. Imig, A.
Brunschweiger, A. Brümmer, B. Guennewig, N. Mittal, S. Kishore, P.
Tsikrika, A. P. Gerber, M. Zavolan and J. Hall, Nat Chem Biol 2015,
1
1, 107-114; d) T. B. Hansen, T. I. Jensen, B. H. Clausen, J. B.
Bramsen, B. Finsen, C. K. Damgaard and J. Kjems, Nature 2013,
95, 384; e) S. Memczak, M. Jens, A. Elefsinioti, F. Torti, J. Krueger,
4
A. Rybak, L. Maier, S. D. Mackowiak, L. H. Gregersen, M.
Munschauer, A. Loewer, U. Ziebold, M. Landthaler, C. Kocks, F. le
Noble and N. Rajewsky, Nature 2013, 495, 333.
[
5
9] a) S. Dangwal and T. Thum, Annu Rev Pharmacol Toxicol 2014,
4, 185-203; b) R. L. Montgomery, T. G. Hullinger, H. M. Semus, B.
A. Dickinson, A. G. Seto, J. M. Lynch, C. Stack, P. A. Latimer, E. N.
Olson and E. van Rooij, Circulation 2011, 124, 1537-1547; c) E. M.
Small, R. J. A. Frost and E. N. Olson, Circulation 2010, 121, 1022-
1
032.
[
10] a) T. J. Marquart, R. M. Allen, D. S. Ory and A. Baldan, Proc
Natl Acad Sci U S A 2010, 107, 12228-12232; b) S. H. Najafi-
Shoushtari, F. Kristo, Y. Li, T. Shioda, D. E. Cohen, R. E. Gerszten
and A. M. Naar, Science 2010, 328, 1566-1569; c) K. J. Rayner, Y.
Suárez, A. Dávalos, S. Parathath, M. L. Fitzgerald, N. Tamehiro, E.
A. Fisher, K. J. Moore and C. Fernández-Hernando, Science 2010,
3
[
28, 1570-1573.
11] C. L. Jopling, M. Yi, A. M. Lancaster, S. M. Lemon and P.
Sarnow, Science 2005, 309, 1577-1581.
12] a) R. Rupaimoole and F. J. Slack, Nat Rev Drug Discov 2017,
[
1
6, 203-222; b) E. Lekka and J. Hall, FEBS Lett 2018, 592, 2884-
2
900.
[
13] a) B. R. Steinkraus, M. Toegel and T. A. Fulga, Wiley Interdiscip
Rev Dev Biol 2016, 5, 311-362; b) L. Chen, L. Heikkinen, C. Wang,
Y. Yang, H. Sun and G. Wong, Briefings in Bioinformatics 2019, 20,
1
836-1852.
[
14] Y. Wang, C. Soneson, A. L. Malinowska, A. Laski, S. Ghosh, A.
Kanitz, L. F. R. Gebert, M. D. Robinson and J. Hall, Nucleic Acids
Research 2020.
[
15] a) H. Baigude, Ahsanullah, Z. Li, Y. Zhou and T. M. Rana,
Angew Chem Int Ed Engl 2012, 51, 5880-5883; Angew. Chem.
012,124, 5982 –5985; b) Y. Matsuyama, A. Yamayoshi, A. Kobori
and A. Murakami, Bioorg Med Chem 2014, 22, 1003-1007.
16] a) G. D. Cimino, H. B. Gamper, S. T. Isaacs and J. E. Hearst,
2
[
Annu Rev Biochem 1985, 54, 1151-1193; b) S. E. Lipson and J. E.
Hearst, Methods Enzymol 1988, 164, 330-341.
[
17] B. Guennewig, M. Stoltz, M. Menzi, A. M. Dogar and J. Hall,
Nucleic Acid Therapeutics 2012, 22, 109-116.
7
This article is protected by copyright. All rights reserved.